一、呼气阳性患者胃幽门螺杆菌的确诊
对于呼气阳性的患者，不一定是HP感染，也有可能是螺杆菌属的猪螺杆菌，或者海尔曼螺杆菌【1】。若患者为胃镜，取到了胃黏膜或者胃液，就可以同时检测HP、猪螺杆菌、海尔曼螺杆菌。并且结合胃镜的图像、患者的临床表现，就可以收集到论文需要的数据。本公司建立了快速检测以上三种螺杆菌的多重PCR技术，可以满足本项目检测的需求。
二、对于胃镜检出不同阶段的病变癌变风险评估
胃黏膜的不同病变阶段，包括慢性非萎缩性胃炎、萎缩性胃炎、胃黏膜异型增生、上皮化生、癌变 五种类型。可以检测胃镜取到的黏膜组织或者胃液中3个为胃癌发生相关的基因甲基化，观察是不是随着病变程度的加重，甲基化的含量依次提高。收集病变程度和甲基化含量的数据，就可以整理得到论文所需要的数据。
三、肠息肉患者复发和癌变风险评估
对应肠镜取到的息肉组织或者肠道冲洗液，也可以分析和肠癌癌变相关的几个甲基化基因含量，收集病变程度和甲基化含量的数据，就可以整理得到论文所需要的数据。
四、肝器官损伤的评估
目前评估肝损伤的血清酶学标志物特异性较差。而F12基因甲基化特异发生在肝脏细胞中【2】。若肝细胞死亡多，则释放到血浆中的F12基因的甲基化片段含量就高【3-4】。我们研发了F12基因甲基化检测荧光定量试剂盒，可以高灵敏检测血浆中的F12基因甲基化含量，结合临床的问题，例如肝病治疗过程中F12基因片段变化的趋势和患者治疗预后的关系，就可以整理得到论文所需要的数据。
【1】欧阳耀斌，等。非幽门螺杆菌致胃黏膜病变研究进展。中国人兽共患病学报，2022，38：69-73.
【2】Liu X, et al, Comprehensive DNA methylation analysis of tissue of origin of plasma cell-free DNA by methylated CpG tandem amplification and sequencing (MCTA-Seq). Clin Epigenetics. 2019, 11(1):93.
【3】Cox, DRA, et al, Low Levels of Hepatocyte-Specific Methylation in Cell-Free DNA Are a Strong Negative Predictor for Acute T Cell-Mediated Rejection Requiring Treatment Following Liver Transplantation. Liver Transpl. 2022, 1024-1038.
【4】Roni Lehmann-Werman, et al, Monitoring liver damage using hepatocyte-specific methylation markers in cell-free circulating DNA. JCI Insight, 2018,3(12):e120687
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